MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xylella fastidiosa M12 chromosome

Total Repeats: 39507

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010513	TGA	2	6	18	23	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729252
2	NC_010513	AGA	2	6	82	87	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170729252
3	NC_010513	TAG	2	6	174	179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729252
4	NC_010513	AGT	2	6	238	243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729252
5	NC_010513	ACA	2	6	269	274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170729252
6	NC_010513	TAC	2	6	295	300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170729252
7	NC_010513	AC	4	8	342	349	50 %	0 %	0 %	50 %	170729252
8	NC_010513	TTG	2	6	366	371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170729252
9	NC_010513	CTCG	2	8	389	396	0 %	25 %	25 %	50 %	170729252
10	NC_010513	TGC	2	6	397	402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729252
11	NC_010513	TGG	2	6	460	465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729252
12	NC_010513	TGC	2	6	496	501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729252
13	NC_010513	TTCG	2	8	549	556	0 %	50 %	25 %	25 %	170729252
14	NC_010513	ATTG	2	8	643	650	25 %	50 %	25 %	0 %	170729252
15	NC_010513	AAG	2	6	687	692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170729252
16	NC_010513	ATT	2	6	737	742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170729252
17	NC_010513	AG	3	6	764	769	50 %	0 %	50 %	0 %	170729252
18	NC_010513	CGAT	2	8	825	832	25 %	25 %	25 %	25 %	170729252
19	NC_010513	CCT	2	6	833	838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170729252
20	NC_010513	A	8	8	925	932	100 %	0 %	0 %	0 %	170729252
21	NC_010513	TAG	2	6	975	980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729252
22	NC_010513	CAA	2	6	1058	1063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170729252
23	NC_010513	ATT	2	6	1101	1106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170729252
24	NC_010513	CTGA	2	8	1196	1203	25 %	25 %	25 %	25 %	170729252
25	NC_010513	GCCG	2	8	1235	1242	0 %	0 %	50 %	50 %	170729252
26	NC_010513	ACA	2	6	1250	1255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170729252
27	NC_010513	GTA	2	6	1694	1699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729253
28	NC_010513	TAA	2	6	1737	1742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170729253
29	NC_010513	GAT	2	6	1792	1797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729253
30	NC_010513	AAT	2	6	1807	1812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170729253
31	NC_010513	GAT	2	6	1913	1918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729253
32	NC_010513	TAT	3	9	2014	2022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170729253
33	NC_010513	TTA	2	6	2033	2038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170729253
34	NC_010513	CAA	2	6	2075	2080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170729253
35	NC_010513	TTA	2	6	2089	2094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170729253
36	NC_010513	TG	3	6	2169	2174	0 %	50 %	50 %	0 %	170729253
37	NC_010513	ATT	2	6	2213	2218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170729253
38	NC_010513	TTA	2	6	2252	2257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170729253
39	NC_010513	ATTG	2	8	2341	2348	25 %	50 %	25 %	0 %	170729253
40	NC_010513	GTG	2	6	2472	2477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729253
41	NC_010513	AAG	3	9	2532	2540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170729253
42	NC_010513	AGG	2	6	2544	2549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170729253
43	NC_010513	ATT	2	6	2601	2606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170729253
44	NC_010513	GTG	2	6	2631	2636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729253
45	NC_010513	TTC	2	6	2668	2673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170729253
46	NC_010513	AGT	2	6	2713	2718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729253
47	NC_010513	GTT	2	6	3075	3080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170729254
48	NC_010513	TTTC	2	8	3094	3101	0 %	75 %	0 %	25 %	170729254
49	NC_010513	T	6	6	3118	3123	0 %	100 %	0 %	0 %	170729254
50	NC_010513	TAAT	2	8	3276	3283	50 %	50 %	0 %	0 %	170729254
51	NC_010513	ATA	2	6	3353	3358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170729254
52	NC_010513	AGT	2	6	3407	3412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729254
53	NC_010513	TCA	2	6	3420	3425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170729254
54	NC_010513	ACG	2	6	3442	3447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729254
55	NC_010513	ATT	2	6	3466	3471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170729254
56	NC_010513	AAC	2	6	3525	3530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170729254
57	NC_010513	AGAA	2	8	3549	3556	75 %	0 %	25 %	0 %	170729254
58	NC_010513	GA	3	6	3638	3643	50 %	0 %	50 %	0 %	170729254
59	NC_010513	AAC	2	6	3648	3653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170729254
60	NC_010513	TTTTAA	2	12	3703	3714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170729254
61	NC_010513	ATGG	2	8	3717	3724	25 %	25 %	50 %	0 %	170729254
62	NC_010513	CGT	2	6	3725	3730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729254
63	NC_010513	TTGA	2	8	3743	3750	25 %	50 %	25 %	0 %	170729254
64	NC_010513	TTTA	2	8	3754	3761	25 %	75 %	0 %	0 %	170729254
65	NC_010513	T	6	6	3920	3925	0 %	100 %	0 %	0 %	170729254
66	NC_010513	TTCT	2	8	3948	3955	0 %	75 %	0 %	25 %	170729254
67	NC_010513	GCT	2	6	4671	4676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729255
68	NC_010513	GGC	2	6	4684	4689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170729255
69	NC_010513	AT	3	6	4690	4695	50 %	50 %	0 %	0 %	170729255
70	NC_010513	TAC	2	6	4715	4720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170729255
71	NC_010513	CAC	2	6	4789	4794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170729255
72	NC_010513	GTCT	2	8	4881	4888	0 %	50 %	25 %	25 %	170729255
73	NC_010513	AGA	2	6	4932	4937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170729255
74	NC_010513	TGG	2	6	4980	4985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729255
75	NC_010513	CGA	2	6	4992	4997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729255
76	NC_010513	TGG	2	6	5016	5021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729255
77	NC_010513	CAA	2	6	5104	5109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170729255
78	NC_010513	TAC	2	6	5172	5177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170729255
79	NC_010513	TCCT	2	8	5260	5267	0 %	50 %	0 %	50 %	170729255
80	NC_010513	AGTT	2	8	5283	5290	25 %	50 %	25 %	0 %	170729255
81	NC_010513	TGAT	2	8	5291	5298	25 %	50 %	25 %	0 %	170729255
82	NC_010513	GTG	2	6	5303	5308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729255
83	NC_010513	CGA	2	6	5319	5324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729255
84	NC_010513	GGT	2	6	5338	5343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729255
85	NC_010513	TTG	2	6	5429	5434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170729255
86	NC_010513	TGG	2	6	5511	5516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729255
87	NC_010513	TGC	2	6	5538	5543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729255
88	NC_010513	TGA	2	6	5616	5621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729255
89	NC_010513	TTC	2	6	5676	5681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170729255
90	NC_010513	GGA	2	6	5751	5756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170729255
91	NC_010513	TGC	2	6	5811	5816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729255
92	NC_010513	GCT	2	6	5830	5835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729255
93	NC_010513	TCG	2	6	5945	5950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729255
94	NC_010513	CTG	2	6	5960	5965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729255
95	NC_010513	A	6	6	5994	5999	100 %	0 %	0 %	0 %	170729255
96	NC_010513	CAT	3	9	6156	6164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170729255
97	NC_010513	T	7	7	6217	6223	0 %	100 %	0 %	0 %	170729255
98	NC_010513	ATTG	2	8	6240	6247	25 %	50 %	25 %	0 %	170729255
99	NC_010513	AT	5	10	6257	6266	50 %	50 %	0 %	0 %	170729255
100	NC_010513	AT	3	6	6438	6443	50 %	50 %	0 %	0 %	170729255
101	NC_010513	CCT	2	6	6492	6497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170729255
102	NC_010513	TGA	2	6	6639	6644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729255
103	NC_010513	GCC	2	6	6655	6660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170729255
104	NC_010513	TTG	2	6	6661	6666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170729255
105	NC_010513	GGA	2	6	6687	6692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170729255
106	NC_010513	TGC	2	6	6764	6769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729255
107	NC_010513	CAAT	2	8	6817	6824	50 %	25 %	0 %	25 %	170729255
108	NC_010513	GAA	2	6	6867	6872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170729255
109	NC_010513	AGC	2	6	6920	6925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729255
110	NC_010513	TAC	2	6	6933	6938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170729255
111	NC_010513	TGC	2	6	6990	6995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729255
112	NC_010513	CAGT	2	8	7341	7348	25 %	25 %	25 %	25 %	170729256
113	NC_010513	TGG	2	6	7390	7395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729256
114	NC_010513	ATTG	2	8	7397	7404	25 %	50 %	25 %	0 %	170729256
115	NC_010513	GTT	3	9	7421	7429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170729256
116	NC_010513	TGA	2	6	7457	7462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729256
117	NC_010513	CAT	2	6	7467	7472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170729256
118	NC_010513	GC	3	6	7473	7478	0 %	0 %	50 %	50 %	170729256
119	NC_010513	T	8	8	7536	7543	0 %	100 %	0 %	0 %	170729256
120	NC_010513	TTGC	2	8	7560	7567	0 %	50 %	25 %	25 %	170729256
121	NC_010513	GC	3	6	7626	7631	0 %	0 %	50 %	50 %	170729256
122	NC_010513	TTTG	2	8	7637	7644	0 %	75 %	25 %	0 %	170729256
123	NC_010513	TCG	2	6	7654	7659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729256
124	NC_010513	ATT	2	6	7685	7690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170729256
125	NC_010513	GT	3	6	7699	7704	0 %	50 %	50 %	0 %	170729256
126	NC_010513	GCCTTT	2	12	7764	7775	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	170729256
127	NC_010513	ATT	2	6	7818	7823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170729256
128	NC_010513	TAC	2	6	7904	7909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170729256
129	NC_010513	TGA	2	6	8030	8035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170729257
130	NC_010513	A	6	6	8035	8040	100 %	0 %	0 %	0 %	170729257
131	NC_010513	GTG	2	6	8123	8128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729257
132	NC_010513	GCA	3	9	8133	8141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729257
133	NC_010513	TTG	2	6	8168	8173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170729257
134	NC_010513	CGTTG	2	10	8227	8236	0 %	40 %	40 %	20 %	170729257
135	NC_010513	T	6	6	8299	8304	0 %	100 %	0 %	0 %	170729257
136	NC_010513	GAA	2	6	8308	8313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170729257
137	NC_010513	A	6	6	8376	8381	100 %	0 %	0 %	0 %	170729257
138	NC_010513	GCT	2	6	8395	8400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729257
139	NC_010513	CGT	2	6	8424	8429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729257
140	NC_010513	TCA	2	6	8436	8441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170729257
141	NC_010513	GAG	2	6	8443	8448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170729257
142	NC_010513	TGC	2	6	8526	8531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729257
143	NC_010513	GACT	2	8	8555	8562	25 %	25 %	25 %	25 %	170729257
144	NC_010513	TTG	2	6	8618	8623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170729257
145	NC_010513	GAA	2	6	8679	8684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170729257
146	NC_010513	CCG	2	6	8710	8715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170729257
147	NC_010513	AGC	2	6	8765	8770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729257
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149	NC_010513	CTG	2	6	8977	8982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729258
150	NC_010513	GGT	2	6	9010	9015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729258
151	NC_010513	CTG	2	6	9026	9031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729258
152	NC_010513	GTC	2	6	9062	9067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729258
153	NC_010513	TGC	2	6	9069	9074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729258
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156	NC_010513	TGGC	2	8	9149	9156	0 %	25 %	50 %	25 %	170729258
157	NC_010513	GCA	2	6	9324	9329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729258
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159	NC_010513	ATCA	2	8	9380	9387	50 %	25 %	0 %	25 %	170729258
160	NC_010513	TGC	2	6	9389	9394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729258
161	NC_010513	CAATTG	2	12	9403	9414	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	170729258
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163	NC_010513	TTA	2	6	9551	9556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170729258
164	NC_010513	AGCA	2	8	9557	9564	50 %	0 %	25 %	25 %	170729258
165	NC_010513	TGC	2	6	9567	9572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729258
166	NC_010513	TTC	2	6	9573	9578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170729258
167	NC_010513	AAAG	2	8	9586	9593	75 %	0 %	25 %	0 %	170729258
168	NC_010513	TTA	2	6	9604	9609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170729258
169	NC_010513	GTG	2	6	9754	9759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729258
170	NC_010513	ACA	2	6	9839	9844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170729258
171	NC_010513	TTA	2	6	9936	9941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170729258
172	NC_010513	GATCA	2	10	9949	9958	40 %	20 %	20 %	20 %	170729258
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174	NC_010513	GCT	2	6	9985	9990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170729258
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249	NC_010513	TCTA	2	8	14397	14404	25 %	50 %	0 %	25 %	170729264
250	NC_010513	CAG	2	6	14428	14433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729264
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252	NC_010513	A	6	6	14476	14481	100 %	0 %	0 %	0 %	170729264
253	NC_010513	GTAC	2	8	14552	14559	25 %	25 %	25 %	25 %	170729264
254	NC_010513	AGC	2	6	14674	14679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729264
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257	NC_010513	GGA	2	6	14962	14967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170729264
258	NC_010513	GAA	2	6	14996	15001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170729264
259	NC_010513	TGTA	2	8	15085	15092	25 %	50 %	25 %	0 %	170729264
260	NC_010513	GGT	2	6	15107	15112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729264
261	NC_010513	GGA	2	6	15178	15183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170729264
262	NC_010513	TC	3	6	15190	15195	0 %	50 %	0 %	50 %	170729264
263	NC_010513	CCG	2	6	15242	15247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170729264
264	NC_010513	CAAC	2	8	15264	15271	50 %	0 %	0 %	50 %	170729264
265	NC_010513	GC	3	6	15281	15286	0 %	0 %	50 %	50 %	170729264
266	NC_010513	CAAAG	2	10	15316	15325	60 %	0 %	20 %	20 %	170729264
267	NC_010513	TAC	2	6	15392	15397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170729264
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269	NC_010513	GGTG	2	8	15787	15794	0 %	25 %	75 %	0 %	170729264
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391	NC_010513	TTAA	2	8	26250	26257	50 %	50 %	0 %	0 %	170729271
392	NC_010513	A	7	7	26284	26290	100 %	0 %	0 %	0 %	170729272
393	NC_010513	GCGGT	2	10	26354	26363	0 %	20 %	60 %	20 %	170729272
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399	NC_010513	AAC	2	6	26842	26847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170729272
400	NC_010513	TCCGTA	2	12	26849	26860	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	170729272
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425	NC_010513	TACC	2	8	28206	28213	25 %	25 %	0 %	50 %	170729272
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431	NC_010513	ATTA	2	8	28420	28427	50 %	50 %	0 %	0 %	170729272
432	NC_010513	GTG	2	6	28433	28438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170729272
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500	NC_010513	CAG	2	6	33220	33225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170729275

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